Epsilon Archive for Student Projects

Abstract

I detta kandidatarbete har det undersökts vilka gener och deras mutationer som styr färguttrycket av brun ull hos svenska fårraser. De raser som undersöktes var ryafår, finullsfår, värmlandsfår och klövsjöfår. Antal besättningar av raserna i Sverige är relativt få och de involveras i olika grad i bevarandearbete för att bibehålla och utveckla rasernas egenskaper. Ökad genetisk variation är ett sätt att förbättra fårraserna. För att undersöka vilka gener som styr pälsfärgen undersöktes blodprov som redan samlats in från de utvalda fårraserna, vilka sedan analyserades med hjälp av multi-species SNP-chip. De nämnda raserna valdes ut baserat på deras förekommande bruna ull. Genotyper från de tidigare kända generna kopplade till färg, Tyrosinase Related Protein 1 (TYRP1) och Melanocortin 1 Receptor (MC1R), undersöktes sedan i Excel. Genen Agouti Signaling Protein (ASIP) har också visats vara kopplad till pälsfärg, men har inte undersökts i detta arbete då data från SNP–chipet inte var användbar. Resultatet från studien visade att mutationen rs402624085 i TYRP1 har stor koppling till fenotypen brun hos vissa raser och endast viss variation i genotyperna fanns i mutationen rs1085637427. Allelfrekvensen för T var 1 hos de bruna ryafåren och klövsjöfåren, medan finullsfåren och värmlandsfåren hade mer varierande frekvens. Med denna studies resultat, samt ytterligare kunskap inom området kan det leda till förbättrad korsningsavel och ökad genetisk variation inom svenska lantraser.

This bachelor´s thesis investigated which genes och their mutations control colour expression of brown wool in Swedish sheep breeds. The breeds studied were ryafår, finullsfår, värmlandsfår and klövsjöfår. The number of herds of these breeds in Sweden is relatively low, and they are involved in varying degrees in conservation projects aimed at preserving and developing the breeds characteristics. Increased genetic variation is one way to improve sheep breeds. To investigate which genes control wool colour, blood samples that were already collected from the selected breeds, were studied and subsequently analysed using a multi-species SNP-chip. The mentioned breeds were chosen based on their occurrence of brown wool. Genotypes from the previously known colour-related genes, Tyrosinase Related Protein 1 (TYRP1) and Melanocortin 1 Receptor (MC1R), were examined in Excel. The gene Agouti Signaling Protein (ASIP) has also been shown to be associated with wool colour, but it was not investigated in this study because the data from the SNP-chip were not usable. The results of the study showed that the mutation rs402624085 in TYRP1 is strongly associated with the brown phenotype in some breeds, and only limited variation in genotypes was found in the mutation rs1085637427. The allele frequency for T was 1 in the brown ryafår and klövsjöfår, while finullsfår and värmlandsfår showed more variable frequencies. With the results of this study, together with further knowledge in this field, this may lead to improved crossbreeding and increased genetic variation within Swedish native breeds.