Epsilon Archive for Student Projects

Abstract

Detta arbete undersöker den genetiska diversiteten hos linderödssvinet, Sveriges enda kvarvarande oförädlade grisras. Genom att analysera ett lokus av det mitokondriella DNA:t (mtDNA) från 18 prover från linderödsgrisar, har studien identifierat en haplotyp som var gemensam hos alla prov-tagna grisar. Detta innebär att den undersökta regionen av mitokondriekromosomen har låg gene-tisk diversitet hos linderödsgrisen. Vilket kan bero på den begränsade grundpopulation som dagens linderödsgrisar utgår ifrån, samt inavel inom raspopulationen. Att alla grisar delade samma haplo-typ indikerar också att founders från alla tre linderödslinjerna kan spåra sitt ursprung till en ge-mensam anmoder.
Den haplotyp som identifierats hos linderödsgrisen jämfördes med flera europeiska och asiatiska vildsvin och tamsvin, och det fylogenetiska trädet som skapats i studien visar att linderödsgrisens haplotyp återfinns hos flera av dessa. Flera europeiska och asiatiska grisraser och vildsvin kunde identifieras med samma haplotyp. Det indikerar ett historiskt genetiskt band mellan dessa gris-raser. När och hur det här bandet har bildats är oklart. Majoriteten av de grisraser och vildsvin som delade haplotyp med linderödssvinet var europeiska, det finns därför indikationer på att anmodern till den här haplotypen hade sitt ursprung på den europeiska kontinenten.

This study investigates the genetic diversity of the Linderöd pig, Sweden's only remaining unre-fined pig breed. By analyzing a locus of mitochondrial DNA (mtDNA) from 18 samples of Linderöd pigs, the study identified a unique haplotype that was common to all sampled pigs. This indicates that the examined region of the mitochondrial chromosome has low genetic diversity in the Linderöd pig, which may be due to the limited founder population from which today's Linde-röd pigs originate, as well as inbreeding within the breed population. The fact that all pigs shared the same haplotype also suggests that founders from all three Linderöd lines can trace their origin to a common ancestor.
The haplotype identified in the Linderöd pig was compared with several European and Asian wild boars and domestic pigs, and the phylogenetic tree created in the study shows that the Linderöd pig's haplotype is found in several of these. Several European and Asian pig breeds and wild boars were identified with the same haplotype. This indicates a historical genetic link between these pig breeds; however, when and how this link was formed is unclear. The majority of pig breeds and wild boars that shared the haplotype with the Linderöd pig were European, indicating that the ancestor of this haplotype originated on the European continent.