Epsilon Archive for Student Projects

Abstract

Med hjälp av high density SNP, en metod för att kartlägga basparspolymorfism, undersöktes släktskap och inavelsgrad hos fem svenska fårraser. Inavelsgraden undersöktes med avseende på heterozygoti samt antal och längd för s.k. runs of homozygosity (ROH). Resultaten visade varierade inavelsgrad hos de olika raserna. Variationen av inavelsgrad inom några av raserna var relativt hög, något som tyder på att det finns genetiskt värdefulla individer att speciellt ta i beaktning vid utvärdering av avelsprogram. För att bidra med kunskaper om specifika genetiskt värdefulla individer behöver fler djurs genom analyseras.

Through high density SNP data, a method of analyzing single neuclotide polymorphism, this study analyses kinship and inbreeding coefficient in five Swedish sheep breeds. The inbreeding coefficient was analyzed with regard to heterozygosity, number and length of runs of homozygosity (ROH). The results showed variation in coefficient of inbreeding across breeds. The variation within some breeds suggests that there are some genetically diverse individuals that are valuable to regard during evaluation of breeding programs. To identify genetically valuable individuals further genomic sequencing within the breeds is required.