Home About Browse Search
Svenska


Källman, Christine, 2009. Diversity of methanotrophic bacteria in rice fields under different crop rotation regimes. SLU, Dept. of Forest Mycology and Plant Pathology, Uppsala. Uppsala: SLU, Dept. of Forest Mycology and Plant Pathology

[img]
Preview
PDF
3MB

Abstract

Metanotrofa bakterier använder metan som kol- och energikälla och hittas framför allt i
våtmarker som risfält, där produktionen av metan är hög. Metanotrofer oxiderar metan till
koldioxid med hjälp av ett enzym som kallas 'perticulate methane monooxygenase', pMMO.
Den aktiva delen av pMMO kodas av subenheten pmoA. Målet med arbetet var att extrahera
och isolera den väl bevarade pmoA genen som är en universell biomarkör för metanotrofer.
Jordprover togs från ett risfält i sydvästra Vietnam där ris, majs och mungböna odlades.
Genen pmoA amplifierades med nested polymerase chain reaction, PCR och ligerades in i en
plasmid vektor. Vektorn, med pmoA genen, transformerades in i kompetenta E. coli celler för att få ut kolonier med sekvenser av pmoA genen. De kolonier som växte plockades och prover skickades till sekvensering. Resultaten, i form av nukleotidsekvenser, jämfördes genom ett fylogenetiskt träd tillsammans med kända metanotrofer av typ I och II. Det visade sig att proverna innehåll metanotrofer av både typ I och II, som formade två kluster i det fylogenetiska trädet. Det fanns mer metanotrofer i behandlingen med samtliga plantor; ris, mungböna och majs än i behandlingen med endast ris. Minst fanns det i jorden där endast ris odlades. I materialet fanns även nya sekvenser som inte hittats tidigare.

Main title:Diversity of methanotrophic bacteria in rice fields under different crop rotation regimes
Authors:Källman, Christine
Supervisor:Högberg, Nils
Examiner:UNSPECIFIED
Series:UNSPECIFIED
Volume/Sequential designation:UNSPECIFIED
Year of Publication:2009
Level and depth descriptor:Other
Student's programme affiliation:Other
Department:(NL, NJ) > Dept. of Forest Mycology and Plant Pathology
(S) > Dept. of Forest Mycology and Plant Pathology
Keywords:methane, crop rotation management, pmoA, particulate methane monooxygenase, methanotroph, methanotrophic bacteria, type X
URN:NBN:urn:nbn:se:slu:epsilon-s-8921
Permanent URL:
http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:slu:epsilon-s-8921
Subjects:SLU > (NL, NJ) > Dept. of Forest Mycology and Plant Pathology
SLU > (S) > Dept. of Forest Mycology and Plant Pathology

Plant ecology
Language:English
Deposited On:17 Nov 2017 10:39
Metadata Last Modified:17 Nov 2017 10:39

Repository Staff Only: item control page

Downloads

Downloads per year (since September 2012)

View more statistics

Downloads
Hits